Unité Zoonoses bactériennes (UZB) du laboratoire de santé animale
Cheffe d’unité : Claire Ponsart
L’unité traite d'infections bactériennes transmissibles de l'animal à l’être humain et constituant un risque majeur de santé publique, comme la brucellose, la chlamydiose, le charbon bactéridien, la mélioïdose, la morve, la tuberculose bovine et la tularémie. Ces maladies animales peuvent être à l’origine de cas humains sévères, parfois mortels, requérant un traitement lourd et/ou prolongé et pouvant être à l’origine d’une incapacité professionnelle plus ou moins prolongée voire de lourds handicaps. Chez l’animal, elles peuvent induire des pertes économiques conséquentes, du fait de la mortalité, d’avortements ou de stérilités induites ainsi que des abattages et/ou restrictions commerciales imposés par la réglementation nationale, européenne ou internationale. Toutes les maladies étudiées (hormis la tuberculose bovine et la chlamydiose) sont dues à des bactéries utilisables à des fins malveillantes (bioterrorisme) et relèvent de la réglementation des « Micro-organismes et toxines hautement pathogènes » (MOT).
Activités de référence
L’unité porte les mandats de laboratoires nationaux de référence pour six maladies (brucellose, charbon bactéridien, chlamydiose aviaire, morve/mélioïdose, tuberculose bovine et tularémie). Il est laboratoire de référence de l'Union européenne (LRUE) pour la brucellose et les maladies équines (morve). Enfin, il porte six mandats de référence de l'OIE (brucellose, épididymite contagieuse du bélier, chlamydiose aviaire, chlamydiose abortive, morve/mélioïdose et tuberculose bovine).
Activités de surveillance
L’unité est impliquée dans différents programmes de surveillance de la Plateforme ESA (épidémiosurveillance santé animale) sur ses thématiques et principalement pour la brucellose et la tuberculose. Elle participe notamment au programme de surveillance de la tuberculose bovine dans la faune sauvage (Sylvatub) et au réseau SAGIR (surveiller pour Agir) pour la brucellose et la tularémie.
Activités d’expertise
L’unité contribue à plusieurs groupes de la plateforme ESA (groupes Tuberculose, Sylvatub, observatoire des avortements, etc.). Les scientifiques de l’unité participent également à plusieurs groupes d’experts, notamment sur les thématiques charbon, brucellose, tuberculose, apportant une contribution significative à la mission de surveillance ainsi qu’à la révision des programmes de lutte pour ces différentes maladies.
Activités de recherche
Les activités de recherche sont en lien direct avec les questions soulevées par les résultats des travaux de référence et concernent la santé et le bien-être animal, l’épidémiosurveillance, l’antibiorésistance et la sécurité sanitaire des aliments. Ces axes sont couverts à la fois dans le cadre des activités de référence (appui scientifique et technique pour les bactéries zoonotiques de l’unité, expertises relatives aux programmes de surveillance pour les thématiques brucellose et tuberculose) et dans le cadre des études épidémiologiques et phylogéographiques réalisées sur différentes thématiques.
Parmi les thématiques étudiées à l’unité UZB, on peut citer :
- caractérisation des Brucella sp., Chlamydia sp., Mycobacterium sp, Bacillus anthracis et des bactéries zoonotiques à transmission vectorisée : Francisella tularensis ; Développement d'outils de différenciation phénotypique ou moléculaire des souches bactériennes permettant un suivi épidémiologique plus précis des foyers et l'établissement des relations entre foyers animaux et cas humains ;
- développement d’approches « One Health », visant à étudier les interactions entre les agents pathogènes, les espèces hôtes et l’environnement. Plusieurs projets sont dédiés à la surveillance de la faune sauvage et au rôle de différentes espèces dans la transmission des agents pathogènes. D’autres projets sont axés sur la présence et la persistance de pathogènes dans l’environnement, notamment les étendues d’eau, avec la possibilité d’investiguer la survie des agents pathogènes dans les amibes ;
- applications des nouvelles technologies haut-débit aux activités de référence (notamment typage moléculaire de souches, conception de puces de détection multipathogènes ou de diagnostic différentiel) et de recherche (approches phylogéographiques, études des gènes de virulence ou de gènes impliqués dans la survie, travaux de modélisation associés aux voies de transmission). Utilisation du séquençage de nouvelle génération (NGS: Next Generation Sequencing), qui permet de séquencer de grandes quantités de génomes en des temps records et à des tarifs désormais plus abordables ;
- réalisation d'études épidémiologiques, à la fois chez les animaux de production pour la validation des outils diagnostiques et/ou de dépistage, dans la faune sauvage et/ou chez les vecteurs pour la surveillance sanitaire et pour l'identification de populations réservoirs et/ou victimes d'infections bactériennes, en collaboration avec d'autres laboratoires de l'Anses et d'autres organismes.